Издательство основано в 1998 году как частное предприятие ООО «Издательство Нота Бене». Его единственным учредителем и управляющим на тот момент был Даниленко Василий Иванович. В дальнейшем, издательство было переименовано в ООО «НБ-Медиа», а с 2011 года его соучредителем становится сын – Даниленко Денис Васильевич.
Вначале издательство специализировалось на издании книг и выпускало с 2000-го года только один печатный журнал «Право и политика».
Примерно с 2004-го года издательство меняет стратегию бизнеса и начинает сокращать выпуск книг, наращивая одновременно производство и открытие новых научных журналов.
Хронология такова:
2000 – начал выходить журнал «Право и политика»;
2004 – открылись два журнала: «Налоги и налогообложение» и «Политика и общество»;
2005 – вышел в свет первый номер научно-популярного ежемесячного журнала «Исторический журнал», обложка которого в дальнейшем стала оформляться под торговой маркой «History Illustrated»;
2008 – открылись журналы: «Философия и культура», «Административное и муниципальное право», «Психология и психотехника»;
2009 – Стартовал журнал «Национальная безопасность/nota bene»;
С этого же времени ООО «НБ-Медиа» стало издателем и распространителем «Журнала зарубежного законодательства и сравнительного правоведения», выходившего в свет с 2005 года, под маркой другого издательства. Учредителем журнала является Институт законодательства и сравнительного правоведения при Правительстве Российской Федерации;
2010 – начал издаваться журнал «Международное право и международные организации», переименованный в дальнейшем в «Международное право и международные организации/International Law and International Organizations»;
2011 – открылись «Исторический журнал: научные исследования», «Культура и искусство», «Филология: научные исследования», «Педагогика и просвещение», «Полицейская деятельность»;
2012 – вышли первые номера печатных журналов «Международные отношения» и «Программные системы и вычислительные методы».
Этот же год ознаменовался открытием нового сайта www.e-notabene.ru и целой серии сетевых изданий, в полном объеме в открытом доступе представленных в Интернет:
«NB: Кибернетика и программирование»
«NB: Вопросы права и политики»
«NB: Проблемы общества и политики»
«NB: Педагогика и просвещение»
«NB: Философские исследования»
«NB: Психология и психотехника»
«NB: Культуры и искусства»
«NB: Национальная безопасность»
«NB: Исторические исследования»
«NB: Международное право»
«NB: Административное право и практика администрирования»
«NB: Филологические исследования»
«NB: Российское полицейское право»
«NB: Международные отношения»
«NB: Экономика, тренды и управление»;
2013 – все журналы представлены в App Store.
Открылись новые печатные журналы:
«Тренды и управление»,
«Урбанистика и рынок недвижимости» (сторонний учредитель),
«Финансовое право и управление», а также зарубежные издания на английском языке:
«PHILHARMONICA. International Music Journal» (печатное и сетевое издание) и
«SENTENTIA. European Journal of Humanities and Social Sciences» (печатное и сетевое издание), которые доступны полностью в открытом доступе.
В полном объеме в открытом доступе представлены в Интернет сетевые издания:
«NB: Финансовое право и управление»,
«Урбанистика»,
«PHILHARMONICA. International Music Journal»,
«SENTENTIA. European Journal of Humanities and Social Sciences»;
Под издательской торговой маркой NOTA BENE стали выходить журналы Московского государственного юридического университета (Академия) «Lex Russica (Закон русский)», издававшийся с 2004 года как ежеквартальный (стал ежемесячным) и «Актуальные проблемы российского права», издававшийся с 2007 года один раз в два месяца (стал ежемесячным).
2014 – Начался выпуск журнала «Союз криминалистов и криминологов» общественной региональной организации с одноименным названием.
В 2016 году Издательство начало выпуск еще 14 новых сетевых изданий:
"Арктика и антарктика"
"Биологические исследования"
"Вопросы здравоохранения"
"Геолог"
"Исследование космоса"
"Машиностроение"
"Продовольственные технологии"
"Ресурсы Мирового океана"
"Сельское хозяйство"
"Транспортный вестник"
"Химические процессы"
"Экологические исследования"
"Электроника и электротехника"
"Энергетический вестник"
С 1 января 2017 года начали выходить в свет в виде сетевых изданий:
"Административное и муниципальное право"
"Исторический журнал: научные исследования"
"Культура и искусство"
"Международное право и международные организации"
"Международные отношения"
"Налоги и налогообложение"
"Национальная безопасность / nota bene"
"Педагогика и просвещение"
"Политика и общество"
"Полицейская деятельность"
"Право и политика"
"Программные системы и вычислительные методы"
"Психология и психотехника"
"Тренды и управление"
"Филология: научные исследования"
"Философия и культура"
"Финансовое право и управление"